I Nekton sono una famiglia di esploratori subacquei che scoprono i segreti nascosti degli oceani, come città sommerse, creature marine e pirati.
La serie segue la famiglia Nekton, una famiglia di avventurosi esploratori subacquei che vive a bordo di un sottomarino all'avanguardia, l'Aronnax, ed esplora aree sconosciute degli oceani della Terra per svelare i misteri delle profondità. Gli antenati della famiglia Nekton sono morti cercando di risolvere l'enigma di come raggiungere la città perduta di Lemuria e si sono rifiutati di abbandonarla. Ora, grazie all'amico di famiglia Nereus, i Nekton sanno perché sono così attratti dalla risoluzione degli enigmi sottomarini: perché sono i discendenti dei Lemuriani.